Впервые на Вологодчине показаны материалы монастырской археологии. В экспозиции представлено более 4 000 археологических предметов различных хронологических периодов: от мезолита (IXтыс. до н.э.) до позднего средневековья. Наиболее полно показан период средневековья, и это делает экспозицию одной из крупнейших на северо-западе России.
В обширных сводчатых палатах монастырской Поварни XVI века размещаются выставки посвященные народному прикладному искусству, ремеслам и промыслам Белозерья.
Музеефикация монашеской кельи XVII века и примыкающих к ней помещений дала возможность представить архитектурный облик и интерьер жилища рядового инока Кирилло-Белозерского монастыря
22.09.2008
Музей посетила поэтесса, писательница, президент информационного содружества "Атлантида", президент Международной лиги писательниц Лариса Николаевна Васильева.
Лариса Васильева, посмотрев музей, в книге почётных посетителей написала:
«В музее потрясающее собрание икон и замечательное внимание к ним, и понимание их сотрудниками. Спасибо вам за чуткость к божественному, которую вы передаёте людям, приходящим сюда.
Лариса Васильева. Писатель, поэт.