Впервые на Вологодчине показаны материалы монастырской археологии. В экспозиции представлено более 4 000 археологических предметов различных хронологических периодов: от мезолита (IXтыс. до н.э.) до позднего средневековья. Наиболее полно показан период средневековья, и это делает экспозицию одной из крупнейших на северо-западе России.
В обширных сводчатых палатах монастырской Поварни XVI века размещаются выставки посвященные народному прикладному искусству, ремеслам и промыслам Белозерья.
Музеефикация монашеской кельи XVII века и примыкающих к ней помещений дала возможность представить архитектурный облик и интерьер жилища рядового инока Кирилло-Белозерского монастыря
28.02.2009
На территории музея проходил районный праздник "Масленица в Кириллове"
В рамках районного праздника «Масленица в Кириллове» в Кирилло-Белозерском музее состоялась презентация итогов проекта «Создание официального сайта Кирилло-Белозерского музея-заповедника», открытие выставки «…Это было недавно, это было давно…»; а также прошли мастер-классы, экскурсии и конкурсно-игровая программа «Широкая Масленица».